2021年度中医药十大学术实质性| 基于多国药典的本草基因组数据库（GPGD）上线

央广网杭州8月30日最新消息 据悉，大成首倡学会组织筹划“2021年度首倡十大人文学科进展”第一部解读，第五期表现形式为“基于多国修订版的本竹叶测序索引（GPGD）上线”。

中国中医科大学中中竹叶药分析所陈汐止分析设计团队依据多国修订版附送的中竹叶药亚种，顺利完成GPGD建设工程并上线。该索引主要依据《中国国务院修订版》《英美两国中竹叶修订版》《日本药发信》《大韩民国修订版》《印度修订版》《突尼斯修订版》《欧洲修订版》及《巴西修订版》等附送903个中竹叶药亚种的34346条资料，是亚太地区首个针对修订版收载中竹叶药亚种的大型测序学索引，可为中竹叶药亚种确认、用药安全、药效成分合成酶种系统解析、优良品种分子结构育种等总体缺少接收者倚靠。

分析背景

传统中竹叶药在亚太地区有数数千年技术的发展上曾，现在仍为亚太地区85%左右人口的主要来源，1981—2019年新批准的近一半叫作天然或甘氨酸，在联合国发布的亚太地区共计60部官方修订版中，42部（占比 70%）都有中竹叶药或天然产物。在新冠肺炎疫情中，传统中中竹叶药在减轻症状、减低心绞痛赴援和死亡赴援上发挥了重要作用。为了遏制传统中竹叶药的分析和技术的发展，分析部门研发了基因序列DNA早先的中竹叶药亚种确认方法，通过全测序测序解析关键效成分的合成酶种系统，通过分子结构来进行育种快速育种优良品种。对中中竹叶药顺利完成基因序列量度，可以前提中中竹叶药的纯正，通过遗传和育种的方法，只能增量道地草药，拓展中中竹叶药水资源，缓和现今中中竹叶草药紧张、价格昂贵、草药质量参差等问题。随着中中竹叶药基因序列分析的推进及测序技术的不断发展，中中竹叶药测序资料促使放缓，而资料格式不分立、存储于多中心地带等问题受到限制中中竹叶药测序资料的技术的发展，建立联系分立的、全面的中中竹叶药测序学索引充满信心。

分析方法及事实

基于亚太地区十二大修订版的中竹叶药亚种接收者，以外《中国国务院修订版》《英美两国中竹叶修订版》《日本药发信》《大韩民国修订版》《印度修订版》《突尼斯修订版》《欧洲修订版》及《巴西修订版》，采集或新产生中竹叶药多不仅仅的测序系统性资料。现今已采集903个中竹叶药亚种的34346条资料，以外 867 个亚种的21872条DNA 早先资料，674个亚种的 2203个小分子测序，以及49个亚种的55个全测序资料等。所有资料顺利完成分立格式化并研发、嵌入多个资料挖掘/分析应用软件。对于亚种、基因序列等接收者研发了引人注意搜索应用软件；基于 DNA 早先资料，研发了亚种确认应用软件；基于测序序列及基因序列注释接收者，研发了序列 BLAST搜索、序列抽取、特别设计测序资料网页 JBrowse 等应用软件。该索引将继续采集中竹叶药组学系统性资料、研发更多分析应用软件。GPGD 以网页形式顺利完成展示，资料 库 网 北站 为Linux+Apache+MySQL+PHP 架 构 ，现今可通过 http：//www.gpgenome.com 顺利完成公开访问。GPGD 可服务于中竹叶药亚种确认、关键性次生人体内种系统解析及优良品种的分子结构来进行育种等总体。

分析价值

该索引是亚太地区首个针对修订版收载中竹叶药亚种的大型测序学索引，有效地将中竹叶药测序资料分立构建，并缺少不同不仅仅的中竹叶药测序学系统性资料及分析应用软件，提升中竹叶药测序资料价值，将为中竹叶药亚种确认、用药安全、药效成分合成酶种系统解析、优良品种分子结构育种等总体缺少极大的便利。

社会价值

该索引由国家重点合作研发方案项目支持，上线以来社会浏览量已经达到10万次，日均超过500次。已与首倡院校、综合性大学、农业大学及科研院所30余家共计享了部分资料。

分析设计团队

中国中医科大学中中竹叶药分析所陈汐止设计团队

系统性专著于2021年6月在Science China-Life Sciences发表